1937年12月13日，日军攻占南京，开始了长达数周的大规模屠杀、抢掠和破坏。本时间轴记录了南京大屠杀的关键事件、主要集体屠杀点及后续审判与纪念。
• 7月7日：卢沟桥事变，全面抗战爆发
• 8月13日：淞沪会战开始
• 11月12日：上海沦陷
• 11月20日：国民政府宣布迁都重庆
• 12月1日：日军大本营下达进攻南京命令
• 12月5日-9日：南京外围战激烈进行
• 12月10日：日军对南京发动总攻
• 12月12日：南京守军开始撤退，唐生智下令撤退
• 日军攻入南京，南京沦陷
• 大规模屠杀、强奸、抢掠和破坏开始
从这一天起，南京城陷入长达六周的血腥恐怖中，遇难者达数十万人。
• 12月14日：汉西门集体屠杀， 约千人遇难
• 12月15日：下关江边集体屠杀，约2万人遇难
• 12月15日：鱼雷营集体屠杀， 约9千人遇难
• 12月15日：汉中门外集体屠杀，约2千人遇难
• 12月16日：中山码头集体屠杀，约5千人遇难
• 12月16日：南京四条巷集体屠杀，约200人遇难
• 12月16日：下关煤炭港集体屠杀，约数万人遇难
• 12月16日：下关中山码头集体屠杀，约5千人遇难
• 12月17日：下关上元门集体屠杀，约3千人遇难
• 12月17日：三叉河边集体屠杀，
• 12月18日：草鞋峡集体屠杀，约5.7万人遇难
• 12月？日：上新河一带集体屠杀，约28730人遇难
• 12月？日：燕子矶江边集体屠杀，约5万人遇难
据1946年2月中国南京军事法庭查证：日军集体大屠杀28案，19万人，零散屠杀858案，15万人。日军在南京进行了长达6个星期的大屠杀，中国军民被枪杀和活埋者达30多万人。
• 1月：屠杀频率逐渐减少但仍在继续
• 2月：国际压力下秩序有所"恢复"
• 3月：伪政权成立，但屠杀零星持续
